過濾器的過濾方式：

物理過濾:它是利用機械辦法將水中較大的顆粒隔出掉。如剩余的飼料顆粒、死亡魚只的尸骨、魚體的排泄物、分泌物、嘔吐物、體表粘液等，一般多使用海綿、噴膠棉、細網目的尼龍網、棕櫚葉纖維等。

生物過濾:培養有益菌菌，通過細菌分解有害元素，如:氨鹽、亞硝酸鹽、硝酸鹽、磷酸鹽等等。常用的濾料有:生化球、陶瓷環、玻璃環、珊瑚砂。

化學過濾:它是利用化學制劑除去水的雜質的辦法，所使用的制劑有水質安定劑、絮凝劑、除藻劑、蛋白質分解劑、除臭劑等等。

吸附過濾:它是木材、煤炭、果殼、動物骨等含碳量極高的物質能吸附海水中的蛋白質、微量元素、脫色、除異味，連臭氧的分子也能被它吸收。魚兒的尿液，水中的微藻以及藥物也都能被它吸附掉。